По итогам субботней квалификации Гран-При Малайзии, который состоится 21 марта 2004 года, первое место занял Михаэль Шумахер (Ferrari), 2-ое и 3-е места соответственно Марк Веббер (Jaguar Cosworth) и Рубенс Баррикелло (Ferrari). Пилоты на стартовой решетке будут расположены в следующем порядке:
| 1 | Михаэль Шумахер | Ferrari | B | 1'33"074 | + 0'00"000 |
| 2 | Марк Веббер | Jaguar Cosworth | M | 1'33"715 | + 0'00"641 |
| 3 | Рубенс Баррикелло | Ferrari | B | 1'33"756 | + 0'00"682 |
| 4 | Хуан-Пабло Монтойя | Williams BMW | M | 1'34"054 | + 0'00"980 |
| 5 | Кими Райкконен | McLaren Mercedes | M | 1'34"164 | + 0'01"090 |
| 6 | Дженсон Баттон | BAR Honda | M | 1'34"221 | + 0'01"147 |
| 7 | Ральф Шумахер | Williams BMW | M | 1'34"235 | + 0'01"161 |
| 8 | Ярно Трулли | Renault | M | 1'34"413 | + 0'01"339 |
| 9 | Дэвид Култхард | McLaren Mercedes | M | 1'34"602 | + 0'01"528 |
| 10 | К. да Матта | Toyota | M | 1'34"917 | + 0'01"843 |
| 11 | Фелипе Масса | Sauber Petronas | B | 1'35"039 | + 0'01"965 |
| 12 | Джанкарло Физикелла | Sauber Petronas | B | 1'35"061 | + 0'01"987 |
| 13 | Кристиан Клиен | Jaguar Cosworth | M | 1'35"158 | + 0'02"084 |
| 14 | Оливье Панис | Toyota | M | 1'35"617 | + 0'02"543 |
| 15 | Ник Хайдфельд | Jordan Ford | B | 1'36"569 | + 0'03"495 |
| 16 | Джанмария Бруни | Minardi Cosworth | B | 1'38"577 | + 0'05"503 |
| 17 | Зольт Баумгартнер | Minardi Cosworth | B | 1'39"272 | + 0'06"198 |
| 18 | Джорджио Пантано | Jordan Ford | B | 1'39"902 | + 0'06"828 |
| 19 | Фернандо Алонсо | Renault | M | ---- | ---- |
| 20 | Такума Сато | BAR Honda | M | ---- | ---- |