Такие стипендии учреждены указом главы государства № 390 от 4 августа 1998 года и предназначены для молодых докторов и кандидатов наук "с целью стимулирования их творческой активности и социальной поддержки". В соответствии с указом, президентские стипендии назначаются ежегодно сроком до 2 лет по результатам открытого конкурса, проводимого НАНБ. При этом 10 стипендий выплачиваются ежемесячно в размере 9 минимальных заработных плат (МЗП) - для докторов наук в возрасте до 45 лет и 20 стипендий по 7 МЗП - для кандидатов наук в возрасте до 35 лет. Ходатайствовать о назначении стипендий имеют право учреждения НАНБ, Белгосуниверситет, министерства и другие государственные организации Беларуси на основании рекомендаций научно-технических и ученых советов своих организаций. НАНБ, совместно с Министерством экономики, объявили также прием ходатайств на назначение стипендий президента Республики Беларусь деятелям науки, образования, культуры, здравоохранения и работникам других отраслей народного хозяйства, независимо от их возраста. Эти стипендии назначаются, в соответствии с тем же указом главы государства, сроком на 1 год, начиная с 1 июля каждого года.